21. Yüzyıl Türkiye Enstitü’nün temel amacı, 21. yüzyılda Türkiye ve Türk Dünyasında gerçekleşmesi gereken politik, ekonomik, kültürel, toplumsal yeniden yapılanma ve küreselleşme çağında Türkiye’nin ve Türk Dünyasının rekabetçi bir kimlik kazanabilmesi ile ilgili radikal reformların fikri alt yapısını hazırlayan bir stratejik akıl merkezini oluşturmaktır.
21. Yüzyıl Türkiye Enstitüsü bünyesinde dinamik bir anlayış ile geliştirilen proje, fikir ve önerilerin toplumsal bir etkinlik kazanması için her türlü basın ve yayın organı kullanılarak karar alıcılar başta olmak üzere topluma erişilecektir. Enstitü, başta Türkiye ve Türk Dünyası olmak üzere bütün dünyada benzeri kurumlar ile ilişki geliştiren, yeni ve etkili bir çalışma tarzını bilgi yoğun ve disiplinli bir anlayış ile uygulayan, derinlemesine analizler yapan bir kuruluş olarak ön plana çıkacaktır.
21. Yüzyıl Türkiye Enstitüsü, bu amaçla, devlet ve bürokrasinin yeniden yapılanması, ekonomik yeniden yapılanma, uluslararası ilişkiler, jeopolitik incelemeler, bölgesel ihtilâflar, uluslararası sorunlar, barış ve savaş, terörizm, uluslararası ekonomik ilişkiler ve finans hareketleri ve kuruluşları ile merkezin uygun göreceği konularla ilgili kapsamlı araştırmalar yapan bir düşünce kuruluşu ve stratejik araştırmalar merkezidir. Ancak, 21. Yüzyıl Türkiye Enstitüsü ayrıca,
- Faaliyet alanlarında stratejik bilgi bankası işlevini yüklenmeyi,
- Faaliyet alanlarında uzman yetiştirmeyi,
- Uzman kişi ve kurumlarla ortak siyaset plânlama çalışmaları yapmayı,
- Taraf olduğu protokollerde öngörülen faaliyetleri yerine getirmeyi,
- Bu yönetmeliğin ruhuna uygun olan, ancak yönetmelikte açıkça öngörülmeyen benzeri diğer alanlarda faaliyette bulunmayı hedeflemektedir.